第1章 システム概要

　スーパーコンピューティング部門では、以下のスーパーコンピューターシステムにより、高度かつ大規模な計算サービスを提供しています。

　この利用の手引きは「SR16000システム」について解説します。SR16000は1ノードあたり32個コアを備えたノードを複数台搭載しており、ノードを並列に動作されるのと同時にノード内でも並列処理を行うことが可能なシステムです。

本章ではSR16000のハードウェア構成を紹介します。

1.2.1 全体構成

SR16000は1ノードあたり32個のコアを備えた計算機（計算ノード）を56台、高速なネットワークで接続したシステムです。全体構成は以下の表のようになっています。

表1-2-1　SR16000全体性能

図1-2-3　ネットワーク構成

1.2.2 ノードの構成

SR16000のノードは、4個のPOWER7プロセッサ(32個コア)、200GBのメモリを搭載しています。POWER7プロセッサの特徴として、1コアあたり30.64GFlops、ノードあたりでは980.48GFlopsの高い演算性能を有しています。
また、1台のコア内で複数のスレッドを実行できるSMT(Simultaneous Multi-Threading)機能を有しており、1台のコアを仮想的に2または4台のコアとして扱うことができます。なお、本センターではSMT設定を2（1台のコアを仮想的に2台のコアとして作動）としています。

表1-2-4　SR16000全体性能
図1-2-5　ノード構成図

SR16000にインストールされている主なソフトウェアは以下の表のとおりです。

表1-3-1　ソフトウェア一覧

項目	ソフトウエア名
OS	AIX 7.1
バッチシステム	NQS 互換機能
コンパイラ	日立製作所製 最適化 FORTRAN90,　最適化 C,　最適化標準 C++ IBM XL C/C++ Enterprise Edition for AIX Java,　GNU コンパイラ
並列化支援	MPI,　OpenMP
数値計算ライブラリなど	MSL2,　MATRIX/MPP,　MATRIX/MPP/SSS,　BLAS,　LAPACK,　ScaLAPACK,　FFTW,　SuperLU
分子計算アプリケーション	Gaussian16
フリーソフトウェア	bash,　tcsh,　zsh,　emacs,　autoconf,　automake,　bzip2,　cvs,　gawk,　gmake,　gzip,　make,　less,　sed,　tar,　vim など

これらのソフトウェアはログインノードまたは計算ノードで使用できます。ログインノードではSSHによるログインおよびコマンドの対話的実行が可能です。主にプログラムの作成・編集、コンパイル、バッチジョブの投入に使用します。ログインノードの資源は多くのユーザーで共有しますので重い処理は行わないようにしてください。計算ノードはバッチジョブシステム(NQS)を通じて使用します。ジョブを投入してから実行されるまでに待ち時間がありますが、自分の順番が回ってきた際には計算ノードの資源を専有できます。通常、すべてのユーザープログラムはバッチジョブとして計算ノードで実行します。
SR16000 にインストールしていないソフトウェアは、ユーザー個人のホームディレクトリにインストールしていただくことで利用可能です（ただし、管理者権限が必要なソフトウェアは使用できません）。

SR16000では研究者が個人単位で利用するための「パーソナルコース」によるサービスのみ行っています。パーソナルコースには、最大で利用できるノード数により複数のコースを用意しています。また、上位コースは下位コースを含みますので、例えばパーソナルコース3の利用者が4ノードのジョブを実行することも可能となっています。

表1-4-1　パーソナルコースの種類