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NQSにおけるプロセス数の指定について

　2007年6月18日から、NQSにおいて1ノードあたりのプロセス数の指定が可能になりました。これにより、ノード内で要素並列化とＭＰＩ並列化を混在させることができます。なお、その際、要素並列化で起動されるスレッド数には注意が必要です。指定方法は以下のとおりです。

プロセス数の指定

　バッチジョブのスクリプトファイルに以下を記述します。1ノードのCPU数（キューにより異なり、8または16）を設定した場合は "#@$-J SS" と同意になります。CPU数を超える値は指定できません。

　#@$-J Tn（n：1ノードあたりのプロセス数）
　例）#@$-J T4　→　4プロセス

スレッド数の指定

　環境変数 HF_PRUNST_THREADNUM にスレッド数（1～16）を設定します（最適化FORTRAN90/77、最適化C、最適化標準C++ 共通）。"1ノードあたりのプロセス数×スレッド数" が1ノードのCPU数を超えると実行効率が低下する場合があります。1ノードのCPU数を超えないように設定してください。

　setenv HF_PRUNST_THREADNUM n　（n：スレッド数）
　例）setenv HF_PRUNST_THREADNUM 4　→　4スレッド
　　　mpirun ./a.out


　※最適化FORTRAN90/77のみ、実行時オプション PRUNST(THREADNUM(n)) による指定も可能です。
　例）mpirun ./a.out -F' PRUNST(THREADNUM(4))'　→　4スレッド

スクリプトファイル記述例

＊1ノード、4プロセス、4スレッド
#@$-q debug
#@$-N 1
#@$-J T4
setenv HF_PRUNST_THREADNUM 4
mpirun ./a.out　（要素並列化モジュール） 		＊1ノード、4プロセス、要素並列化なし
#@$-q debug
#@$-N 1
#@$-J T4
mpirun ./a.out　（非要素並列化モジュール）
＊4ノード、8プロセス、8スレッド
#@$-q debug
#@$-N 4
#@$-J T2
setenv HF_PRUNST_THREADNUM 8
mpirun ./a.out　（要素並列化モジュール） 		＊2ノード、32プロセス、要素並列化なし
#@$-q debug
#@$-N 2
#@$-J SS （または "#@$-J T16" ）
mpirun ./a.out　（非要素並列化モジュール）
＊1ノード、1プロセス、16スレッド
#@$-q debug
#@$-N 1
./a.out　（要素並列化モジュール）