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目次

東大センターにおけるスーパーコンピューター利用入門 -SR11000編- 第4版(2009年3月発行)

目次

  1. システム概要
    1.1. システム構成
    1.2. ノード構成
    1.3. ソフトウェア
    1.4. フリーソフトウェア
  2. 利用者登録
  3. ログイン方法
    3.1. 概要
    3.2. 接続情報
    3.3. Windowsシステムからのログイン方法
     ① PuTTY の入手
     ② 鍵の生成
     ③ 鍵のSR11000システムへの登録
     ④ ログイン
     ⑤ ファイルコピー
    3.4. UNIXシステムからのログイン方法
     ① 鍵の生成
     ② 鍵のSR11000システムへの登録
     ③ ログイン
     ④ ファイルコピー
    3.5. 鍵について(Windows、UNIX共通)
     ① Web登録システムの有効期間
     ② Web登録システムに入力できる鍵
     ③ 鍵の追加と変更
     ④ 秘密鍵の管理
     ⑤ 別システムへのログインに使用している鍵の流用
  4. シェルとコマンド
    4.1. ログインメッセージ
    4.2. ログアウト
    4.3. シェルとコマンド
     ① 標準入出力
     ② 初期設定ファイル
     ③ プロセスの強制終了
     ④ オンラインマニュアル
     ⑤ 電子メール
     ⑥ ファイル転送
     ⑦ CPUリソース情報 
  5. ファイルとディレクトリー
  6. 要素並列とジョブの形態
    6.1. 要素並列処理
    6.2. ジョブの形態
     ① スカラージョブ
     ② 要素並列ジョブ
     ③ ノード内要素並列+ノード間MPIジョブ
     ④ ノード内およびノード間MPIジョブ
  7. コンパイルと実行
    7.1. FORTRAN
    7.2. C、C++
    7.3. 実行
  8. システム資源
    8.1. CPU資源
    8.2. メモリー資源
  9. NQS(バッチジョブ)
    9.1. NQSとは
    9.2. ジョブクラスとキュー
    9.3. スクリプトファイルの作成
    9.4. ジョブの実行(投入および確認)
    9.5. ジョブの結果
    9.6. ジョブのキャンセル
    9.7. ジョブの開始、終了メール
    9.8. 実行例
  10. FORTRANのコンパイルと実行の詳細
    10.1. コンパイルとリンク
     ① オプション
     ② ファイル名
    10.2. オプションと機能
     ① 最適化オプション
     ② 要素並列化オプション
     ③ OpenMP
     ④ 64ビットアドレッシングモード
     ⑤ ログメッセージ
     ⑥ 性能モニター
     ⑦ ソースプログラム差分コンパイル
     ⑧ オブジェクト再コンパイル
     ⑨ 制限コンパイル
     ⑩ デバッグオプション
     ⑪ トレースバックマップ
     ⑫ 言語仕様の拡張
    10.3. 実行時オプション
    10.4. サービスサブルーチン
     ① プログラムの時間計測
     ② 他社Fortranで標準的にサポートされているサービスサブルーチン
  11. 並列アプリケーション
     11.1. 並列実行(PRUNコマンド)
     11.2. MPI
  12. 数値計算ライブラリー
    12.1. MATRIX/MPP
    12.2. MSL2
    12.3. BLAS・LAPACK・SCALAPACK
  13. ファイル入出力
    13.1. データー形式
    13.2. ファイル形式
    13.3. ファイル接続
     ① 標準入出力
     ② OPEN文
     ③ 環境変数FTnnFxxx
     ④ 特定ファイル名 ft.nn

付録

  • viエディターの使い方
  • 高速ファイル転送ソフト SRFT について
  • 複数プログラムの実行方法と環境変数について
  • Gaussian03の使い方
  • 超並列ジョブ(64ノード)実行サービスについて
  • ジョブスケジューリングシステムについて
  • 計算リソース追加オプション
  • ジョブクラス制限値
  • 利用負担金
  • マニュアル一覧
  • マニュアルWeb閲覧サービス
  • センターによく寄せられる質問とその回答集(FAQ)