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目次
東大センターにおけるスーパーコンピューター利用入門 -SR11000編- 第4版(2009年3月発行)
目次
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システム概要
1.1. システム構成
1.2. ノード構成
1.3. ソフトウェア
1.4. フリーソフトウェア - 利用者登録
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ログイン方法
3.1. 概要
3.2. 接続情報
3.3. Windowsシステムからのログイン方法
① PuTTY の入手
② 鍵の生成
③ 鍵のSR11000システムへの登録
④ ログイン
⑤ ファイルコピー
3.4. UNIXシステムからのログイン方法
① 鍵の生成
② 鍵のSR11000システムへの登録
③ ログイン
④ ファイルコピー
3.5. 鍵について(Windows、UNIX共通)
① Web登録システムの有効期間
② Web登録システムに入力できる鍵
③ 鍵の追加と変更
④ 秘密鍵の管理
⑤ 別システムへのログインに使用している鍵の流用
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シェルとコマンド
4.1. ログインメッセージ
4.2. ログアウト
4.3. シェルとコマンド
① 標準入出力
② 初期設定ファイル
③ プロセスの強制終了
④ オンラインマニュアル
⑤ 電子メール
⑥ ファイル転送
⑦ CPUリソース情報 - ファイルとディレクトリー
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要素並列とジョブの形態
6.1. 要素並列処理
6.2. ジョブの形態
① スカラージョブ
② 要素並列ジョブ
③ ノード内要素並列+ノード間MPIジョブ
④ ノード内およびノード間MPIジョブ -
コンパイルと実行
7.1. FORTRAN
7.2. C、C++
7.3. 実行 -
システム資源
8.1. CPU資源
8.2. メモリー資源 -
NQS(バッチジョブ)
9.1. NQSとは
9.2. ジョブクラスとキュー
9.3. スクリプトファイルの作成
9.4. ジョブの実行(投入および確認)
9.5. ジョブの結果
9.6. ジョブのキャンセル
9.7. ジョブの開始、終了メール
9.8. 実行例 -
FORTRANのコンパイルと実行の詳細
10.1. コンパイルとリンク
① オプション
② ファイル名
10.2. オプションと機能
① 最適化オプション
② 要素並列化オプション
③ OpenMP
④ 64ビットアドレッシングモード
⑤ ログメッセージ
⑥ 性能モニター
⑦ ソースプログラム差分コンパイル
⑧ オブジェクト再コンパイル
⑨ 制限コンパイル
⑩ デバッグオプション
⑪ トレースバックマップ
⑫ 言語仕様の拡張
10.3. 実行時オプション
10.4. サービスサブルーチン
① プログラムの時間計測
② 他社Fortranで標準的にサポートされているサービスサブルーチン -
並列アプリケーション
11.1. 並列実行(PRUNコマンド)
11.2. MPI -
数値計算ライブラリー
12.1. MATRIX/MPP
12.2. MSL2
12.3. BLAS・LAPACK・SCALAPACK -
ファイル入出力
13.1. データー形式
13.2. ファイル形式
13.3. ファイル接続
① 標準入出力
② OPEN文
③ 環境変数FTnnFxxx
④ 特定ファイル名 ft.nn
付録
- viエディターの使い方
- 高速ファイル転送ソフト SRFT について
- 複数プログラムの実行方法と環境変数について
- Gaussian03の使い方
- 超並列ジョブ(64ノード)実行サービスについて
- ジョブスケジューリングシステムについて
- 計算リソース追加オプション
- ジョブクラス制限値
- 利用負担金
- マニュアル一覧
- マニュアルWeb閲覧サービス
- センターによく寄せられる質問とその回答集(FAQ)